フォルダー オプションからシステム ファイルを表示する設定にすると警告がでますが、このメッセージは表示しないようにすることができます。
HKLM\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\Advanced\Folder\SuperHidden キーを開き
WarningIfNotDefault 値をバックアップ後、削除します。
Windows 7 でバックアップした設定ファイルです。
Windows Registry Editor Version 5.00
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\Advanced\Folder\SuperHidden]
"WarningIfNotDefault"="@shell32.dll,-28964"
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\Advanced\Folder\SuperHidden]
"WarningIfNotDefault"="@shell32.dll,-28964"